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姓  名:
周 兵
学  科:
系统生物学
电话/传真:
+86-10-64807308 / 
电子邮件:
zhoubing@ioz.ac.cn
通讯地址:
北京市朝阳区北辰西路1号院5号
中国科学院动物研究所,干细胞与生殖生物学国家重点实验室 100101
更多信息:
细胞微环境系统生物学研究组     
简历:
  周兵,男,博士,研究员,博士生导师,中国科学院动物研究所细胞微环境系统生物学研究组组长;中国科学院“百人计划”入选者。
  2004年于湖南大学信息管理与信息系统系获得学士学位,2012年于中国科学院遗传与发育生物学研究所获得生物信息学博士学位,师从韩敬东研究员从事衰老系统生物学方向的研究。2012-2014年在中科院遗传发育所曹晓风实验室进行博士后研究工作,从事组蛋白去甲基化酶的表观遗传学精确调控机制的研究。2014-2018年在美国加州大学圣地亚哥分校UCSD付向东实验室进行博士后研究工作,从事RNA代谢调控网络与染色质高级结构的功能基因组方面的研究。研究内容主要围绕功能基因组学与表观遗传学的分子调控机制,结合计算生物学与系统生物学的方法,探索多基因的精确表达调控、表观遗传信息的靶向识别以及染色质的高级结构与功能,取得了一系列研究成果,分别发表于Nature Biotechnology、Nature Genetics、Genome Research、PNAS、RNA等SCI刊物上共15篇,其中发表第一或共一作者文章6篇,获得美国应用专利1项。(1)设计并开发了RNA-染色质互作组大规模测序技术GRID-seq的计算与分析流程,首次揭示了新生RNA转录活动受限于周围染色质的三维结构,表明空间临近的多基因形成活跃的社区结构,存在相互反馈调控的转录微环境(Nature Biotechnology 2017)。(2)揭示了真核生物核小体H3K27me3和H3K4me3的去甲基化酶REF6和JMJ14在高等植物中精确调控基因表达的序列依赖性识别与靶向机制(Nature Genetics 2016; Cell Discovery 2015)。(3)建立小鼠饮食与能量干预模型,揭示了能量限制相关调控通路,发现了能量过剩促进过氧化物酶体的过量增殖,显著降低了细胞对活性氧耐受程度,从而加速衰老进程(PNAS 2012)。(4)开发并实现了大规模数据的整合分析框架与流程,构建了多维异质性生物学大数据的贝叶斯网络推断与分析模型,成功地揭示了人类CD4阳性T细胞20多种核小体表观遗传学修饰的基因表达调控网络(Genome Research 2008)。
研究领域:
  本实验室今后的研究重点将主要围绕细胞的身份决定与维持、干性与可塑性的细胞微环境、器官衰老与再生等科学问题,运用计算生物学与大规模高通量实验技术相结合的方法,从功能基因组学、表观遗传学、染色质高级结构以及单细胞生物学等方面,系统性地阐释多细胞微环境的性质、功能与分子调控机制。
社会任职:
获奖及荣誉:
承担科研项目情况:
代表论著:
  1. Xiao Li^, Bing Zhou^, Liang Chen, Lan-Tao Gou, Hairi Li, Xiang-Dong Fu. GRID-seq reveals the global RNA-chromatin interactome. Nature biotechnology, 2017.
  2. Jinsong Qiu^, Bing Zhou^, Felicitas Thol, Yu Zhou, Liang Chen, Changwei Shao, Christopher DeBoever, Jiayi Hou, Hairi Li, Anuhar Chaturvedi, Arnold Ganser, Rafael Bejar, Dong-Er Zhang, Xiang-Dong Fu, Michael Heuser. Distinct splicing signatures affect converged pathways in myelodysplastic syndrome patients carrying mutations in different splicing regulators. RNA, 2016.
  3. Xia Cui^, Falong Lu^, Qi Qiu^, Bing Zhou^, Lianfeng Gu, Shuaibin Zhang, Yanyuan Kang, Xiekui Cui, Xuan Ma, Qingqing Yao, Jinbiao Ma, Xiaoyu Zhang, Xiaofeng Cao. REF6 recognizes a specific DNA sequence to demethylate H3K27me3 and regulate organ boundary formation in Arabidopsis. Nature genetics, 2016.
  4. Shuaibin Zhang^, Bing Zhou^, Yanyuan kang, Xia Cui, Ao Liu, Angelique Deleris, Maxim V. C. Greenberg, Xiekui Cui, Qi Qiu, Falong Lu, James A. Wohlschlegel, Steven E. Jacobsen and Xiaofeng Cao. C-terminal domains of histone demethylase JMJ14 interact with a pair of NAC transcription factors to mediate specific chromatin association. Cell Discovery, 2015.
  5. Bing Zhou^, Liu Yang^, Shoufeng Li, Jialiang Huang, Haiyang Chen, Lei Hou, Jinbo Wang, Christopher D. Green, Zhen Yan, Xun Huang, Matt Kaeberlein, Li Zhu, Huasheng Xiao, Yong Liu, and Jing-Dong J. Han. Midlife gene expressions identify modulators of aging through dietary interventions. PNAS, 2012.
  6. Hong Yu^, Shanshan Zhu^, Bing Zhou^, Huiling Xue, and Jing-Dong Jackie Han. Inferring causal relationships among different histone modifications and gene expression. Genome Research, 2008.

专利:

  • Xiang-Dong Fu, Bing Zhou, Xiao Li. Methods for global rna-chromatin interactome discovery. US patent, 2018: US20180039729A1.
写给考生的话: